Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C20orf78Q9BR46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C20orf78Q9BR46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms