Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX50Q9BQ39 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX50Q9BQ39 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms