Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VGLL1Q99990 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VGLL1Q99990 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VGLL1Q99990 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms