Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRQ99707 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRQ99707 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTRQ99707 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRQ99707 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRQ99707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRQ99707 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRQ99707 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRQ99707 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRQ99707 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTRQ99707 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTRQ99707 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTRQ99707 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRQ99707 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTRQ99707 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTRQ99707 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTRQ99707 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRQ99707 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRQ99707 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRQ99707 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRQ99707 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRQ99707 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRQ99707 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTRQ99707 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTRQ99707 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTRQ99707 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTRQ99707 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRQ99707 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms