Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITX2Q99697 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITX2Q99697 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITX2Q99697 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms