Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMD1Q99460 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMD1Q99460 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMD1Q99460 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms