Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF13CQ96RJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms