Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC6Q96NY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC6Q96NY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLIC6Q96NY7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLIC6Q96NY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms