Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TSNARE1Q96NA8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1Q96NA8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TSNARE1Q96NA8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms