Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC138Q96M89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC138Q96M89 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms