Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf72Q96LT7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf72Q96LT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms