Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PRAC1Q96KF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PRAC1Q96KF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms