Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1LQ96KA5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1LQ96KA5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms