Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP47Q96K76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP47Q96K76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP47Q96K76 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms