Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAMP1Q96JM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHAMP1Q96JM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHAMP1Q96JM3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHAMP1Q96JM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms