Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCPIP1Q96JH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCPIP1Q96JH7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms