Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN17Q96FV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN17Q96FV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms