Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLCD1Q96CP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLCD1Q96CP7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLCD1Q96CP7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms