Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2E3Q969T4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3Q969T4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2E3Q969T4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms