Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX21Q969T3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX21Q969T3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX21Q969T3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms