Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAMP4Q969E2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCAMP4Q969E2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAMP4Q969E2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP4Q969E2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms