Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HERVK_113Q902F9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERVK_113Q902F9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113Q902F9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113Q902F9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms