Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SREK1Q8WXA9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SREK1Q8WXA9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.6 ms