Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEPDC1BQ8WUY9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC1BQ8WUY9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC1BQ8WUY9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms