Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUF8

FAM172A, Protein FAM172A, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM172AQ8WUF8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM172AQ8WUF8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM172AQ8WUF8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM172AQ8WUF8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM172AQ8WUF8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM172AQ8WUF8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM172AQ8WUF8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms