Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1L1Q8NHS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOT1L1Q8NHS2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GOT1L1Q8NHS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1L1Q8NHS2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1L1Q8NHS2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1L1Q8NHS2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1L1Q8NHS2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOT1L1Q8NHS2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms