Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP35Q8NFH5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP35Q8NFH5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms