Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLRC2Q8NBF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLRC2Q8NBF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLRC2Q8NBF2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NHLRC2Q8NBF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NHLRC2Q8NBF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NHLRC2Q8NBF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms