Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIML2Q8N7C3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIML2Q8N7C3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIML2Q8N7C3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms