Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

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Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VWA5B2Q8N398 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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