Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC13Q8IYE1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC13Q8IYE1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms