Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS6Q8IU80 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS6Q8IU80 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS6Q8IU80 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS6Q8IU80 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS6Q8IU80 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMPRSS6Q8IU80 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms