Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LDLRAD3Q86YD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD3Q86YD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms