Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF554Q86TJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF554Q86TJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms