Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHA9Q7RTU4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHA9Q7RTU4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHLHA9Q7RTU4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms