Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINGO4Q6UY18 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO4Q6UY18 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO4Q6UY18 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms