Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AAGABQ6PD74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AAGABQ6PD74 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AAGABQ6PD74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms