Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C22orf39Q6P5X5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C22orf39Q6P5X5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms