Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC41PQ6P2S7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TTC41PQ6P2S7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC41PQ6P2S7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms