Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEPROQ6NW34 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEPROQ6NW34 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEPROQ6NW34 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms