Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDB3Q6NSJ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHLDB3Q6NSJ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHLDB3Q6NSJ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHLDB3Q6NSJ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms