Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDE2Q6IQ49 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDE2Q6IQ49 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDE2Q6IQ49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms