Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ETFRF1Q6IPR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETFRF1Q6IPR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms