Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF6Q5VXH4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF6Q5VXH4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF6Q5VXH4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms