Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPRC1Q5VV67 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PPRC1Q5VV67 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PPRC1Q5VV67 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PPRC1Q5VV67 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
PPRC1Q5VV67 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PPRC1Q5VV67 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PPRC1Q5VV67 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PPRC1Q5VV67 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PPRC1Q5VV67 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms