Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C12orf60Q5U649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C12orf60Q5U649 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C12orf60Q5U649 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C12orf60Q5U649 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms