Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MARCH8Q5T0T0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MARCH8Q5T0T0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms