Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms