Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAPCD1Q5SSQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAPCD1Q5SSQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms