Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB2Q5IJ48 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB2Q5IJ48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms